Sarı-lacivertlilerin bundan önceki 6 katılımda elde ettiği en büyük başarı, 2007-2008 sezonunda çeyrek finalde yer almak oldu.
Fenerbahçe, 1996-1997, 2001-2002, 2004-2005, 2005-2006, 2007-2008 ve 2008-2009 sezonlarında yaptığı toplam 40 maçta 11 galibiyet, 6 beraberlik, 23 mağlubiyet aldı.
Sarı-lacivertliler, 2002-2003 ve 2006-2007 sezonlarında da ön eleme turlarını geçemediği için Şampiyonlar Ligi'ne katılmadı.
1996-1997 SEZONU
C) Grubu:
Rapid Wien - Fenerbahçe: 1 - 1
Fenerbahçe - Juventus..: 0 - 1
Fenerbahçe - M. United.: 0 - 2
M. United - Fenerbahçe.: 0 - 1
Fenerbahçe - Rapid Wien: 1 - 0
Juventus - Fenerbahçe..: 2 - 0
2001-2002 SEZONU
(F) Grubu:
Fenerbahçe - Barcelona.: 0 - 3
Fenerbahçe - O. Lyon...: 0 - 1
Leverkusen - Fenerbahçe: 2 - 1
O. Lyon - Fenerbahçe...: 3 - 1
Fenerbahçe - Leverkusen: 1 - 2
Barcelona - Fenerbahçe.: 1 - 0
2004-2005 SEZONU (D) Grubu:
Fenerbahçe - S. Prag..: 1 - 0
M. United - Fenerbahçe: 6 - 2
Fenerbahçe - O. Lyon..: 1 - 3
O. Lyon - Fenerbahçe..: 4 - 2
S. Prag - Fenerbahçe..: 0 - 1
Fenerbahçe - M. United: 3 - 0
2005-2006 SEZONU (E) Grubu:
Milan - Fenerbahçe........: 3 - 1
Fenerbahçe - PSV Eindhoven: 3 - 0
Fenerbahçe - Schalke 04...: 3 - 3
Schalke - Fenerbahçe......: 2 - 0
Fenerbahçe - Milan........: 0 - 4
PSV Eindhoven - Fenerbahçe: 2 - 0
2007-2008 SEZONU (G) Grubu
Fenerbahçe - Inter........: 1 - 0
CSKA Moskova - Fenerbahçe.: 2 - 2
PSV Eindhoven - Fenerbahçe: 0 - 0
Fenerbahçe - PSV Eindhoven: 2 - 0
Inter - Fenerbahçe........: 3 - 0
Fenerbahçe - CSKA Moskova.: 3 - 1
2. Tur:
Fenerbahçe - Sevilla: 3 - 2
Sevilla - Fenerbahçe: 3 - 2 (Penaltılarla)
Çeyrek Final:
Fenerbahçe - Chelsea: 2 - 1
Chelsea - Fenerbahçe: 2 - 0
2008-2009 SEZONU (G) Grubu:
Porto - Fenerbahçe......: 3 - 1
Fenerbahçe - Dinamo Kiev: 0 - 0
Fenerbahçe - Arsenal....: 2 - 5
Arsenal - Fenerbahçe....: 0 - 0
Fenerbahçe - Porto......: 1 - 2
Dinamo Kiev - Fenerbahçe: 1 - 0